水源热泵空调钻井目前在中国的发展正赶上最好的历史机遇，国家一系列环保节能法规的颁布，给节能环保效益明显的地缘热泵带去了无穷的商机，且中国如今各行各业的建设正如火如荼开展中，地源热泵在建筑节能中的效益尤其明显，使其在近年来的应用得到更大的发展，然地源热泵的发展并非一帆风顺，下面我们将分析地源热泵在发展过程中面临的6大问题，在此，我们仅进行抛砖引玉，如何解决以下问题，留待学者自行追寻。
（1）观念方面：水源热泵空调钻井和燃气、燃煤供热技术相对成熟，使得人们选择地源热泵系统时会面临阻力。
（2）暖通空调技术与其它技术的配合：地源热泵技术是暖通空调技术与钻井技术相结合的综合技术，两者缺一不可，这要求工程组织者和工程技术人员能够合理协调、做好充分的技术经济分析。
（3）对环境的影响：目前地下水的回灌技术不完善，在一定程度上会影响以水为低位热源的地源热泵的进一步推广;此外土壤源热泵空调系统钻井对土壤热、湿及盐分迁移的影响研究有待进一步深入，如何使不利因素减少到最小是必须考虑的问题。
（4）初投资问题：并不是所有的地源热泵系统都是经济合理的，由于钻井费用可能占到整个系统初投资的50％以上，有些投资者可能会回到传统的空调形式。
（5）水源热泵空调钻井安装维护：目前地源热泵系统的安装费用较高，与电制冷、天然气加热系统的500～800元/ton相比，地源热泵的600～1000元/ton（1ton=1.01605t）显然是高的，它的回收期是5～8年;而且地源热泵系统的维护较为困难，这在一定程度上会影响它的使用。
（6）水源热泵空调钻井土壤特性：土壤的特性随地点的变化而有所差别，在一地区的研究结果可能完全不适用于另一地区，必须进行相应的修正甚至重新研究。
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水源热泵空调钻井发展过程中遇到的六大挑战